马来西亚-中国商务理事会（简称为马中商务理事会）的成立可回溯至2002年。在时任马来西亚首相敦马哈迪医生和来访的中国国家副主席胡锦涛的联合见证下，中国国际贸易促进委员会（简称为中国贸促会）与马来西亚方的对口单位一起设立中国-马来西亚联合商务理事会。马中商务理事会随即正式确立为马来西亚方的对口单位，旨在加强马中两国的双边关系，提升两国有关单位、企业乃至个体之间的交流与合作，以利惠两国的商贸投资社群。

马中商务理事会为在中国经商的马来西亚商家，也为在马来西亚经商的中国商家提供资讯与咨询，鉴定各类商务课题和困难，并且同心合力寻求解决的方案。马中商务理事会不仅为两国企业家提供马中双边的商务资讯和投资机会，也让中国投资者更加了解马来西亚的良好经商环境和投资机会。

2012年4月，马中商务理事会根据1965年公司法令注册为非营利有限公司，正式成为法定组织。同年5月3日马中商务理事会根据新公司章程召开第一次理事会会议，掀开了马中商务理事会的新篇章。